Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms