Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms