Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTXN3Q4LDR2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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