Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FHOD3Q2V2M9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FHOD3Q2V2M9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms