Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC57Q2TAC2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms