Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC96Q2M329 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC96Q2M329 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC96Q2M329 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC96Q2M329 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC96Q2M329 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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