Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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