Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CA9Q16790 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CA9Q16790 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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