Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms