Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms