Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTRK3Q16288 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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