Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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CCDC6Q16204 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC6Q16204 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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