Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUM3Q15397 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PUM3Q15397 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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