Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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R3HDM1Q15032 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
R3HDM1Q15032 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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