Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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