Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms