Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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SHROOM2Q13796 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHROOM2Q13796 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
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