Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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