Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR4Q13639 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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