Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR3Q13615 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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