Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LSAMPQ13449 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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