Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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