Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms