Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NME3Q13232 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NME3Q13232 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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