Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DUSP4Q13115 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP4Q13115 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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