Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK3Q13003 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
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