Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GRIK2Q13002 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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