Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms