Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms