Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms