Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms