Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms