Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GBE1Q04446 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms