Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARID5AQ03989 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms