Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OC90Q02509 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
OC90Q02509 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
OC90Q02509 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OC90Q02509 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms