Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCCD1P59942 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms