Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FBXW4P57775 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms