Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB38P57729 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB38P57729 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB38P57729 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB38P57729 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB38P57729 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms