Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2BFSP57053 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2BFSP57053 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2BFSP57053 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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