Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCCSP53701 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HCCSP53701 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms