Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX2P52951 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX2P52951 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms