Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RAB5CP51148 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5CP51148 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5CP51148 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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