Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSRP3P50461 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms