Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK1EP49674 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK1EP49674 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms