Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTRNP46939 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTRNP46939 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms