Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGER3P43115 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms