Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPGP40121 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPGP40121 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms