Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms