Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL3P36405 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL3P36405 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL3P36405 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL3P36405 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ARL3P36405 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ARL3P36405 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL3P36405 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ARL3P36405 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ARL3P36405 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms