Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms